Зартан, який видає себе за президента Сполучених Штатів, звинувачує «Джи Ай Джо» у викраденні ядерних боєголовок з Пакистану. Усю команду знищують під час військового удару, однією з жертв якого стає Дюк. Єдиними, хто вижив, залишаються Роудблок, Флінт і Леді Джей. Тим часом Штормова Тінь і Світлячок рятують Командира Кобри з підземної в’язниці суворого режиму в Німеччині, залишивши Дестро позаду. Зартан оголошує, що «Кобра» стане головним оборонним підрядником США. Під час втечі Штормова Тінь отримує поранення і відступає до храму в Гімалаях, щоб одужати. Одужавши, Штормова Тінь виявляє, що об’єднав свої сили з «Джо». Разом вони проникають на вершину і викривають Зартана, якого вбиває Блокпост. Командир Кобри тікає під час битви, а Штормова Тінь зникає, помстившись за смерть свого дядька. Справжнього Президента звільнено, а Джої відновлено на посаді.

Дивитись G.I. Joe: Атака кобри 2 (2013) українською у HD якості безкоштовно